Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP8A1Q9Y2Q0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms