Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASS4Q9NQ75 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASS4Q9NQ75 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms