Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC82Q8N4S0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC82Q8N4S0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms