Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RSBN1Q5VWQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RSBN1Q5VWQ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms