Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC93Q567U6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC93Q567U6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms