Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF1CQ15572 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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