Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRKQ15262 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRKQ15262 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
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