Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A2Q12974 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTP4A2Q12974 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms