Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 AI2Q0055 2565 nt2.63□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RGR1YLR071C 3249 nt2.63□□□□□ -1.99
MSK1P32048 PSY4YBL046W 1326 nt2.63□□□□□ -1.99
MSK1P32048 VPS30YPL120W 1674 nt2.63□□□□□ -1.99
MSK1P32048 DBF20YPR111W 1695 nt2.63□□□□□ -1.99
MSK1P32048 FUS2YMR232W 2034 nt2.63□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SEC7YDR170C 6030 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 BPT1YLL015W 4680 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 CHO2YGR157W 2610 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RIM13YMR154C 2184 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SLU7YDR088C 1149 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RMD6YEL072W 696 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YIL054WYIL054W 318 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YLR230WYLR230W 306 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SMD2YLR275W 333 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YNL319WYNL319W 441 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RRG7YOR305W 729 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 KRE2YDR483W 1329 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 TFB1YDR311W 1929 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 ARK1YNL020C 1917 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RAX2YLR084C 3663 nt2.62□□□□□ -1.99
MSK1P32048 NSA1YGL111W 1392 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 JJJ2YJL162C 1752 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 PSY2YNL201C 2577 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 CEP3YMR168C 1827 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 BIT61YJL058C 1632 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 ECM29YHL030W 5607 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RAV2YDR202C 1056 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 COX23YHR116W 456 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 UTP11YKL099C 753 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SDH3YKL141W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 TPK3YKL166C 1197 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 LIP2YLR239C 987 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 GRE2YOL151W 1029 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 NTC20YBR188C 423 nt2.61□□□□□ -1.99
MSK1P32048 Q0255Q0255 1419 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 MRS2YOR334W 1413 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 PRP8YHR165C 7242 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SLK19YOR195W 2466 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YGR017WYGR017W 894 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 BTN2YGR142W 1233 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RSR1YGR152C 819 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SFT1YKL006C-A 294 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YAR069CYAR069C 294 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YMR181CYMR181C 465 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 ATX1YNL259C 222 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 NGL1YOL042W 1092 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SHG1YBR258C 429 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 ERT1YBR239C 1590 nt2.6□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SEN54YPL083C 1404 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 FRE2YKL220C 2136 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 YOL057WYOL057W 2136 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 CDC20YGL116W 1833 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 NSE4YDL105W 1209 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SAE2YGL175C 1038 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SUI2YJR007W 915 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RPC25YKL144C 639 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 CSI2YOL007C 1026 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 RXT2YBR095C 1293 nt2.59□□□□□ -1.99
MSK1P32048 SLH1YGR271W 5904 nt2.59□□□□□ -2
MSK1P32048 YLR278CYLR278C 4026 nt2.59□□□□□ -2
MSK1P32048 ASI3YNL008C 2031 nt2.59□□□□□ -2
MSK1P32048 SRB4YER022W 2064 nt2.59□□□□□ -2
MSK1P32048 VPS53YJL029C 2469 nt2.59□□□□□ -2
MSK1P32048 EXO5YBR163W 1758 nt2.59□□□□□ -2
MSK1P32048 MTC3YGL226W 372 nt2.58□□□□□ -2
MSK1P32048 REC102YLR329W 795 nt2.58□□□□□ -2
MSK1P32048 YBL010CYBL010C 843 nt2.58□□□□□ -2
MSK1P32048 RPL16BYNL069C 597 nt2.58□□□□□ -2
MSK1P32048 RSN1YMR266W 2862 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 ENT5YDR153C 1236 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 YDR262WYDR262W 819 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 IES6YEL044W 501 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 PNC1YGL037C 651 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 RPL11BYGR085C 525 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 MRPL20YKR085C 588 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 SDO1YLR022C 753 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 YPT6YLR262C 648 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 YLR297WYLR297W 390 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 GIM5YML094W 492 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 AIM36YMR157C 768 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 RPL11AYPR102C 525 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 YPR203WYPR203W 309 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 VPS38YLR360W 1320 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 CDC55YGL190C 1581 nt2.57□□□□□ -2
MSK1P32048 UBC13YDR092W 462 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 KEI1YDR367W 666 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 STE2YFL026W 1296 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 CPR7YJR032W 1182 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 YLR217WYLR217W 324 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 YLR257WYLR257W 966 nt2.56□□□□□ -2
MSK1P32048 MAL33YBR297W 1407 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.1 ms