Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2E1P29083 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2E1P29083 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms