Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
NEFLP07196 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NEFLP07196 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NEFLP07196 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NEFLP07196 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NEFLP07196 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NEFLP07196 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NEFLP07196 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEFLP07196 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NEFLP07196 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms