Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NECAP2Q9NVZ3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms