Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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HIF1AQ16665 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIF1AQ16665 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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