Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 TMA64YDR117C 1698 nt3.42□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 RTT109YLL002W 1311 nt3.42□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 HUL5YGL141W 2733 nt3.42□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 GSC2YGR032W 5688 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 VPS30YPL120W 1674 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 snR5snR5 204 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 RRP42YDL111C 798 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 YDL163WYDL163W 303 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 FIN1YDR130C 876 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 PEX10YDR265W 1014 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 UPF3YGR072W 1164 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 YIR014WYIR014W 729 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 EMC2YJR088C 879 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 SYM1YLR251W 594 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 YLR252WYLR252W 306 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 OCA2YNL056W 594 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 ATX2YOR079C 942 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 KRE2YDR483W 1329 nt3.41□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 SEC27YGL137W 2670 nt3.4□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 ITT1YML068W 1395 nt3.4□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 THR4YCR053W 1545 nt3.4□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 GLC3YEL011W 2115 nt3.4□□□□□ -1.86
PUF2Q12221 ASM4YDL088C 1587 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 CLB3YDL155W 1284 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SLX9YGR081C 633 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RGI2YIL057C 495 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SNX4YJL036W 1272 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YJR111CYJR111C 852 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YCT1YLL055W 1596 nt3.4□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 IDP2YLR174W 1239 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 UBX4YMR067C 1251 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SIN4YNL236W 2925 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RBL2YOR265W 321 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YRO2YBR054W 1035 nt3.4□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 CUR1YPR158W 759 nt3.4□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR170CYPR170C 336 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YDL199CYDL199C 2064 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 CPA2YJR109C 3357 nt3.4□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 HEF3YNL014W 3135 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 GDS1YOR355W 1569 nt3.39□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR013CYCR013C 648 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YDL050CYDL050C 372 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YPD1YDL235C 504 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 ECM11YDR446W 909 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RSR1YGR152C 819 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 CIC1YHR052W 1131 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YHR213WYHR213W 597 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 NFU1YKL040C 771 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 TPK3YKL166C 1197 nt3.39□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YAR062WYAR062W 597 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RPA43YOR340C 981 nt3.39□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SYT1YPR095C 3681 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 DUN1YDL101C 1542 nt3.39□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 PBP4YDL053C 558 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SEC4YFL005W 648 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 DSE2YHR143W 978 nt3.38□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 NNF1YJR112W 606 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SRP21YKL122C 504 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 GOT1YMR292W 417 nt3.38□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 MSN1YOL116W 1149 nt3.38□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YJL049WYJL049W 1353 nt3.38□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SWI1YPL016W 3945 nt3.38□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 ARP5YNL059C 2268 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 PAU10YDR542W 363 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 VAB2YEL005C 849 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 PAU11YGL261C 363 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 PAU13YHL046C 363 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YIL029CYIL029C 429 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 ATG10YLL042C 504 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 PAU4YLR461W 363 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RPL19BYBL027W 570 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 IGO1YNL157W 507 nt3.37□□□□□ -1.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL235CYNL235C 432 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RPB5YBR154C 648 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YML096WYML096W 1578 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 TMA108YIL137C 2841 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YLR177WYLR177W 1887 nt3.37□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 DAN4YJR151C 3486 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 HDA2YDR295C 2025 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 NUP159YIL115C 4383 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YDL187CYDL187C 330 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RTR1YER139C 681 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 BCD1YHR040W 1101 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 MRP49YKL167C 414 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SUC2YIL162W 1599 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 PHR1YOR386W 1698 nt3.36□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 VPS74YDR372C 1038 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 MIG3YER028C 1185 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 NSA2YER126C 786 nt3.35□□□□□ -1.87
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