Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPB1P53618 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPB1P53618 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB1P53618 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB1P53618 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPB1P53618 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms