Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA4P43358 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA4P43358 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAGEA4P43358 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAGEA4P43358 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAGEA4P43358 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms