Protein–RNA interactions for Protein: P39543

SOP4, Protein SOP4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4P39543 SMA2YML066C 1110 nt2.61□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YBL055CYBL055C 1257 nt2.61□□□□□ -1.99
SOP4P39543 DIA1YMR316W 1011 nt2.61□□□□□ -1.99
SOP4P39543 MIC27YNL100W 705 nt2.61□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.61□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YNL011CYNL011C 1335 nt2.61□□□□□ -1.99
SOP4P39543 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 MED1YPR070W 1701 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 PPH3YDR075W 927 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 SUB1YMR039C 879 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 INP1YMR204C 1263 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 TYE7YOR344C 876 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YOR387CYOR387C 621 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 NFT1YKR103W 3657 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 AVT5YBL089W 1380 nt2.6□□□□□ -1.99
SOP4P39543 POL4YCR014C 1749 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 ECM29YHL030W 5607 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 ROG1YGL144C 2058 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 HBT1YDL223C 3141 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 RPL13AYDL082W 600 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 SHR3YDL212W 633 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YFH7YFR007W 1062 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 MST27YGL051W 705 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 RPL27AYHR010W 411 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 CUP1-1YHR053C 186 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 CUP1-2YHR055C 186 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 MRPL16YBL038W 699 nt2.59□□□□□ -1.99
SOP4P39543 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.59□□□□□ -2
SOP4P39543 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.59□□□□□ -2
SOP4P39543 SAP1YER047C 2694 nt2.59□□□□□ -2
SOP4P39543 RIF1YBR275C 5751 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 MAK5YBR142W 2322 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 YBR259WYBR259W 2067 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 CWH41YGL027C 2502 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 SEC4YFL005W 648 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 YGL242CYGL242C 546 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 YGR107WYGR107W 450 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 SYS1YJL004C 612 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 RPF2YKR081C 1035 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 RPL6BYLR448W 531 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 MRPL33YMR286W 261 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 YBL062WYBL062W 381 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 YNL276CYNL276C 396 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 RGR1YLR071C 3249 nt2.58□□□□□ -2
SOP4P39543 TCB2YNL087W 3537 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 PEX5YDR244W 1839 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 EAP1YKL204W 1899 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 BCK1YJL095W 4437 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 RPN9YDR427W 1182 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 RPL22BYFL034C-A 369 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 COG7YGL005C 840 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 YNL203CYNL203C 612 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 GCY1YOR120W 939 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 LCL1YPL056C 306 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 FRE8YLR047C 2061 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 MAK11YKL021C 1407 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 PEX6YNL329C 3093 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 YDR239CYDR239C 2364 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 FLO11YIR019C 4104 nt2.57□□□□□ -2
SOP4P39543 VAC14YLR386W 2643 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 SEC7YDR170C 6030 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 MTM1YGR257C 1101 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 LSM8YJR022W 330 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 YKL070WYKL070W 510 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 JIP3YLR331C 378 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 RCE1YMR274C 948 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 MRPL17YNL252C 846 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 snR35snR35 204 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 PAM1YDR251W 2493 nt2.56□□□□□ -2
SOP4P39543 YPD1YDL235C 504 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 DIG2YDR480W 972 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 MRPL9YGR220C 810 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 RPL19BYBL027W 570 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 YMR046CYMR046C 1323 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 YCK2YNL154C 1641 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 SKO1YNL167C 1944 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 YOL162WYOL162W 648 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 MDM36YPR083W 1740 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 APA1YCL050C 966 nt2.55□□□□□ -2
SOP4P39543 TRM82YDR165W 1335 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 YME2YMR302C 2553 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 MAM1YER106W 909 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 CMC1YKL137W 336 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 MRPL38YKL170W 417 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 YLR339CYLR339C 552 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 PRM6YML047C 1059 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 RIM9YMR063W 720 nt2.54□□□□□ -2
SOP4P39543 SWD3YBR175W 948 nt2.54□□□□□ -2
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