Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NEFLP07196 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEFLP07196 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEFLP07196 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEFLP07196 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEFLP07196 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEFLP07196 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEFLP07196 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NEFLP07196 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NEFLP07196 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms