Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UPK3BL2E5RIL1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UPK3BL2E5RIL1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms