Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BHMG1C9JSJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHMG1C9JSJ3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms