Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TCF20Q9UGU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TCF20Q9UGU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TCF20Q9UGU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TCF20Q9UGU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCF20Q9UGU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TCF20Q9UGU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCF20Q9UGU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms