Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF47

DNAJC5B, DnaJ homolog subfamily C member 5B, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC5BQ9UF47 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.26■■■■■ 5.8
DNAJC5BQ9UF47 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
DNAJC5BQ9UF47 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
DNAJC5BQ9UF47 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC51.25■■■■■ 5.79
DNAJC5BQ9UF47 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
DNAJC5BQ9UF47 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
DNAJC5BQ9UF47 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC51.22■■■■■ 5.79
DNAJC5BQ9UF47 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
DNAJC5BQ9UF47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.2■■■■■ 5.79
DNAJC5BQ9UF47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
DNAJC5BQ9UF47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC51.16■■■■■ 5.78
DNAJC5BQ9UF47 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC51.15■■■■■ 5.78
DNAJC5BQ9UF47 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC51.12■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.12■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.1■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC51.09■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
DNAJC5BQ9UF47 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC51.05■■■■■ 5.76
DNAJC5BQ9UF47 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
DNAJC5BQ9UF47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
DNAJC5BQ9UF47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
DNAJC5BQ9UF47 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC51.02■■■■■ 5.76
DNAJC5BQ9UF47 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
DNAJC5BQ9UF47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
DNAJC5BQ9UF47 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
DNAJC5BQ9UF47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC50.95■■■■■ 5.75
DNAJC5BQ9UF47 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC50.94■■■■■ 5.75
DNAJC5BQ9UF47 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC50.89■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.89■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC50.89■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC50.88■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
DNAJC5BQ9UF47 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC50.86■■■■■ 5.73
DNAJC5BQ9UF47 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
DNAJC5BQ9UF47 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC50.84■■■■■ 5.73
DNAJC5BQ9UF47 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
DNAJC5BQ9UF47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC50.83■■■■■ 5.73
DNAJC5BQ9UF47 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC50.82■■■■■ 5.73
DNAJC5BQ9UF47 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
DNAJC5BQ9UF47 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.8■■■■■ 5.72
DNAJC5BQ9UF47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
DNAJC5BQ9UF47 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC50.75■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC50.72■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC50.71■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC50.69■■■■■ 5.71
DNAJC5BQ9UF47 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC50.68■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC50.65■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC50.64■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC50.63■■■■■ 5.7
DNAJC5BQ9UF47 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC50.62■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC50.6■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC50.6■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC50.59■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.56■■■■■ 5.69
DNAJC5BQ9UF47 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
DNAJC5BQ9UF47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC50.55■■■■■ 5.68
DNAJC5BQ9UF47 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC50.54■■■■■ 5.68
DNAJC5BQ9UF47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
DNAJC5BQ9UF47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
DNAJC5BQ9UF47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC50.5■■■■■ 5.67
DNAJC5BQ9UF47 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.5■■■■■ 5.67
DNAJC5BQ9UF47 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
DNAJC5BQ9UF47 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC50.46■■■■■ 5.67
DNAJC5BQ9UF47 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms