Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CDK12Q9NYV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CDK12Q9NYV4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CDK12Q9NYV4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CDK12Q9NYV4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CDK12Q9NYV4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK12Q9NYV4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK12Q9NYV4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CDK12Q9NYV4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CDK12Q9NYV4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CDK12Q9NYV4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms