Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNRC6CQ9HCJ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNRC6CQ9HCJ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNRC6CQ9HCJ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNRC6CQ9HCJ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNRC6CQ9HCJ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNRC6CQ9HCJ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms