Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2OQ9C0C9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2OQ9C0C9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2OQ9C0C9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
UBE2OQ9C0C9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE2OQ9C0C9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
UBE2OQ9C0C9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBE2OQ9C0C9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UBE2OQ9C0C9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBE2OQ9C0C9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
UBE2OQ9C0C9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBE2OQ9C0C9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
UBE2OQ9C0C9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UBE2OQ9C0C9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms