Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF560Q96MR9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF560Q96MR9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF560Q96MR9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF560Q96MR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF560Q96MR9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF560Q96MR9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZNF560Q96MR9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms