Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00208Q96KT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00208Q96KT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00208Q96KT6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00208Q96KT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00208Q96KT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms