Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRC59Q96AG4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRC59Q96AG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
LRRC59Q96AG4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC59Q96AG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC59Q96AG4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
LRRC59Q96AG4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC59Q96AG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRC59Q96AG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC59Q96AG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC59Q96AG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms