Protein–RNA interactions for Protein: Q92583

CCL17, C-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL17Q92583 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL17Q92583 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL17Q92583 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL17Q92583 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL17Q92583 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL17Q92583 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms