Protein–RNA interactions for Protein: Q92540

SMG7, Protein SMG7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG7Q92540 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG7Q92540 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMG7Q92540 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMG7Q92540 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG7Q92540 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMG7Q92540 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMG7Q92540 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMG7Q92540 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms