Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BEST2Q8NFU1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEST2Q8NFU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEST2Q8NFU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BEST2Q8NFU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BEST2Q8NFU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BEST2Q8NFU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BEST2Q8NFU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BEST2Q8NFU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BEST2Q8NFU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BEST2Q8NFU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEST2Q8NFU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEST2Q8NFU1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BEST2Q8NFU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms