Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZY2

ABCA7, ATP-binding cassette sub-family A member 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA7Q8IZY2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ABCA7Q8IZY2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCA7Q8IZY2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCA7Q8IZY2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCA7Q8IZY2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCA7Q8IZY2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCA7Q8IZY2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCA7Q8IZY2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms