Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z442

PKD1L2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L2Q7Z442 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD1L2Q7Z442 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD1L2Q7Z442 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD1L2Q7Z442 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD1L2Q7Z442 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PKD1L2Q7Z442 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD1L2Q7Z442 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD1L2Q7Z442 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms