Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPNS3Q6ZMD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPNS3Q6ZMD2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPNS3Q6ZMD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPNS3Q6ZMD2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPNS3Q6ZMD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPNS3Q6ZMD2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPNS3Q6ZMD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms