Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C4orf17Q53FE4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C4orf17Q53FE4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
C4orf17Q53FE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C4orf17Q53FE4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C4orf17Q53FE4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C4orf17Q53FE4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C4orf17Q53FE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms