Protein–RNA interactions for Protein: Q12502

LDB19, Protein LDB19, yeastyeast

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB19Q12502 YBL081WYBL081W 1107 nt11.35□□□□□ -0.59
LDB19Q12502 NUR1YDL089W 1455 nt11.35□□□□□ -0.59
LDB19Q12502 OAZ1YPL052W 879 nt11.34□□□□□ -0.59
LDB19Q12502 ANP1YEL036C 1503 nt11.34□□□□□ -0.59
LDB19Q12502 RTC4YNL254C 1206 nt11.33□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 NAT5YOR253W 531 nt11.33□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 SNG1YGR197C 1644 nt11.31□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 YCR087WYCR087W 516 nt11.31□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 IZH4YOL101C 939 nt11.31□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 HEM12YDR047W 1089 nt11.3□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 BTT1YDR252W 450 nt11.3□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 KRE28YDR532C 1158 nt11.3□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 YIR016WYIR016W 798 nt11.3□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 AIM41YOR215C 558 nt11.3□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 PHO89YBR296C 1725 nt11.29□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 YDR010CYDR010C 333 nt11.29□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 SUA5YGL169W 1281 nt11.29□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 YAP6YDR259C 1152 nt11.28□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 AIM45YPR004C 1035 nt11.28□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 PCH2YBR186W 1695 nt11.27□□□□□ -0.6
LDB19Q12502 HAT1YPL001W 1125 nt11.27□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 MIC10YCL057C-A 294 nt11.27□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 SHM2YLR058C 1410 nt11.26□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 RRS1YOR294W 612 nt11.26□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 YGR283CYGR283C 1026 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 VPS20YMR077C 666 nt11.25□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 RAD51YER095W 1203 nt11.24□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 RRP15YPR143W 753 nt11.24□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 YLR111WYLR111W 333 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 YNL319WYNL319W 441 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 NDJ1YOL104C 1059 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 RET2YFR051C 1641 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 GUT2YIL155C 1950 nt11.23□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 SGT2YOR007C 1041 nt11.21□□□□□ -0.61
LDB19Q12502 YJR056CYJR056C 711 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 RPF2YKR081C 1035 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 TVP38YKR088C 1014 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 RXT2YBR095C 1293 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 ICE2YIL090W 1476 nt11.19□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 LYS4YDR234W 2082 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 NCP1YHR042W 2076 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 OCA4YCR095C 1089 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 MRP20YDR405W 792 nt11.18□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 XDJ1YLR090W 1380 nt11.17□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 YFR045WYFR045W 930 nt11.17□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 NVJ2YPR091C 2313 nt11.17□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 YLH47YPR125W 1365 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 RRT6YGL146C 936 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 YMR187CYMR187C 1296 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 RCE1YMR274C 948 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 END3YNL084C 1050 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 NCE102YPR149W 522 nt11.16□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 RPN9YDR427W 1182 nt11.15□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 YAP7YOL028C 738 nt11.15□□□□□ -0.62
LDB19Q12502 VAC17YCL063W 1272 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 BUD16YEL029C 939 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 HAT2YEL056W 1206 nt11.14□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 NIT1YIL164C 600 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 TIF34YMR146C 1044 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 YNR029CYNR029C 1290 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 HOS2YGL194C 1359 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 BNA2YJR078W 1362 nt11.13□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 YLR169WYLR169W 354 nt11.12□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 MRI1YPR118W 1236 nt11.12□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 BOP3YNL042W 1191 nt11.11□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 YKR015CYKR015C 1707 nt11.11□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 SHE9YDR393W 1371 nt11.11□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 CSL4YNL232W 879 nt11.1□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 TRM10YOL093W 882 nt11.1□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 GDH3YAL062W 1374 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 YEA4YEL004W 1029 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 ERJ5YFR041C 888 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 COG5YNL051W 1212 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 STE4YOR212W 1272 nt11.09□□□□□ -0.63
LDB19Q12502 NDL1YLR254C 570 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 COQ2YNR041C 1119 nt11.08□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt11.07□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 SDH5YOL071W 489 nt11.06□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 PIB2YGL023C 1908 nt11.05□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 RTF1YGL244W 1677 nt11.05□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 THI80YOR143C 960 nt11.05□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 SRT1YMR101C 1032 nt11.04□□□□□ -0.64
LDB19Q12502 MAF1YDR005C 1188 nt11.02□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.02□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 PCI8YIL071C 1335 nt11.02□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 APM1YPL259C 1428 nt11.01□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 ADH7YCR105W 1086 nt11.01□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 ARC35YNR035C 1029 nt11.01□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 POP4YBR257W 840 nt11.01□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 snR56snR56 88 nt11□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 YLR349WYLR349W 507 nt11□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 TAP42YMR028W 1101 nt11□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 MIC12YBR262C 321 nt11□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 PCL10YGL134W 1302 nt11□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 PAU15YIR041W 375 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 IRC9YJL142C 393 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 YMR181CYMR181C 465 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 LEU2YCL018W 1095 nt10.99□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 HHO1YPL127C 777 nt10.98□□□□□ -0.65
LDB19Q12502 ATG29YPL166W 642 nt10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.8 ms