Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 TAZ1YPR140W 1146 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 SVF1YDR346C 1446 nt8.71□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 YDL158CYDL158C 309 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YIR016WYIR016W 798 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 RSA3YLR221C 663 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YLR283WYLR283W 945 nt8.71□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YDR433WYDR433W 441 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 AQY2YLL052C 450 nt8.7□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 MAF1YDR005C 1188 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 LIP2YLR239C 987 nt8.69□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 ACO2YJL200C 2370 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 RTN2YDL204W 1182 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 SPC25YER018C 666 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 RAI1YGL246C 1164 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YGR011WYGR011W 327 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 SLX1YBR228W 915 nt8.68□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 HMG2YLR450W 3138 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 MET2YNL277W 1461 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 snR34snR34 203 nt8.67□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 DLD2YDL178W 1593 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YNL319WYNL319W 441 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YPR011CYPR011C 981 nt8.66□□□□□ -1.02
TY1A-DR3Q12441 YGR201CYGR201C 678 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 NUP57YGR119C 1626 nt8.64□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 NPP1YCR026C 2229 nt8.63□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 ALG3YBL082C 1377 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 ATG22YCL038C 1587 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 PRM5YIL117C 957 nt8.62□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 YMR210WYMR210W 1350 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 YCR049CYCR049C 447 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 VPS60YDR486C 690 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 TPO4YOR273C 1980 nt8.61□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 PRM4YPL156C 855 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 ALD4YOR374W 1560 nt8.6□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 MSA2YKR077W 1092 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 YNL303WYNL303W 348 nt8.59□□□□□ -1.03
TY1A-DR3Q12441 PEX22YAL055W 543 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 CSI1YMR025W 888 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 YOL107WYOL107W 1029 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 SUT2YPR009W 807 nt8.58□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 PLB1YMR008C 1995 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 NMD4YLR363C 657 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 IDP3YNL009W 1263 nt8.57□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 ECM9YKR004C 1134 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 YMR209CYMR209C 1374 nt8.56□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 UGA4YDL210W 1716 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 YKR040CYKR040C 504 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 OSW1YOR255W 837 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 snR189snR189 189 nt8.55□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 YIL092WYIL092W 1902 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 AVT6YER119C 1347 nt8.54□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 ERV46YAL042W 1248 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 DBR1YKL149C 1218 nt8.53□□□□□ -1.04
TY1A-DR3Q12441 YKL097CYKL097C 411 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 REX3YLR107W 1215 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 CCT4YDL143W 1587 nt8.52□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YGR283CYGR283C 1026 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YJL067WYJL067W 351 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YOR325WYOR325W 474 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 RER1YCL001W 567 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 NPL6YMR091C 1308 nt8.51□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 GOR1YNL274C 1053 nt8.5□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 MHO1YJR008W 1017 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YLR169WYLR169W 354 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 SPC24YMR117C 642 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 VAM3YOR106W 852 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YOR139CYOR139C 393 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 ZTA1YBR046C 1005 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 LSB5YCL034W 1065 nt8.49□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 FES1YBR101C 873 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 UGP1YKL035W 1500 nt8.48□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 HAT2YEL056W 1206 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 MAD2YJL030W 591 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 YNL024CYNL024C 741 nt8.47□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 ZRT3YKL175W 1512 nt8.46□□□□□ -1.05
TY1A-DR3Q12441 PTC7YHR076W 1032 nt8.46□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 RTG3YBL103C 1461 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 RSF1YMR030W 1131 nt8.45□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ILV3YJR016C 1758 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ARC35YNR035C 1029 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ISR1YPR106W 1332 nt8.44□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 YHL008CYHL008C 1884 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 BUD16YEL029C 939 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 COS6YGR295C 1146 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 YHR022CYHR022C 771 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 YLR198CYLR198C 360 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ERG29YMR134W 714 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 RRP40YOL142W 723 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 URA8YJR103W 1737 nt8.43□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ELO1YJL196C 933 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 DSC2YOL073C 969 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ISA2YPR067W 558 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 ARR1YPR199C 885 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 UTR1YJR049C 1593 nt8.42□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 PUS7YOR243C 2031 nt8.41□□□□□ -1.06
TY1A-DR3Q12441 NUR1YDL089W 1455 nt8.41□□□□□ -1.06
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