Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 CMP2YML057W 1815 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 GET2YER083C 858 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 YMR074CYMR074C 438 nt9.04□□□□□ -0.96
TY1A-BLQ12266 YCR102CYCR102C 1107 nt9.02□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 NBP35YGL091C 987 nt9.02□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 YAT1YAR035W 2064 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 ECM9YKR004C 1134 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 IRC14YOR135C 342 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 MRI1YPR118W 1236 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 HAS1YMR290C 1518 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 NUF2YOL069W 1356 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 RRT5YFR032C 870 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 PAU16YKL224C 372 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 SCO2YBR024W 906 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 PRM4YPL156C 855 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 ATG17YLR423C 1254 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 ZTA1YBR046C 1005 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 PUS5YLR165C 765 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 TAF4YMR005W 1167 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 CSI1YMR025W 888 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 SLX1YBR228W 915 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-BLQ12266 MSA2YKR077W 1092 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 YOL107WYOL107W 1029 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 SUT2YPR009W 807 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 YJR056CYJR056C 711 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 MIR1YJR077C 936 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 TIF34YMR146C 1044 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 YNL303WYNL303W 348 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 IDI1YPL117C 867 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 NDI1YML120C 1542 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 YDR010CYDR010C 333 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 LIP2YLR239C 987 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 OSW1YOR255W 837 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 PAU7YAR020C 168 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 SHH4YLR164W 507 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 SHB17YKR043C 816 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 COX16YJL003W 357 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 PLB1YMR008C 1995 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 YNL319WYNL319W 441 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 MCT1YOR221C 1083 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 CTR1YPR124W 1221 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-BLQ12266 FHN1YGR131W 525 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 SWP1YMR149W 861 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 YDR008CYDR008C 351 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 TIR3YIL011W 810 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 COA2YPL189C-A 207 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 HSL7YBR133C 2484 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 GAT1YFL021W 1533 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 CUS2YNL286W 858 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 SFA1YDL168W 1161 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 FAF1YIL019W 1041 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 HIF1YLL022C 1158 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 ERG12YMR208W 1332 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 PRM5YIL117C 957 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 snR189snR189 189 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 RER1YCL001W 567 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 UBA4YHR111W 1323 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 YLR283WYLR283W 945 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 ALD4YOR374W 1560 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 SPT20YOL148C 1815 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-BLQ12266 THI74YDR438W 1113 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 MRS3YJL133W 945 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 RET2YFR051C 1641 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 MAF1YDR005C 1188 nt8.82□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 PRO1YDR300C 1287 nt8.82□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 POM34YLR018C 900 nt8.82□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 SKI6YGR195W 741 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 LSC2YGR244C 1284 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 YGR283CYGR283C 1026 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 PZF1YPR186C 1290 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 INA1YLR413W 2028 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 YMR114CYMR114C 1107 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 NUR1YDL089W 1455 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 RPC82YPR190C 1965 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 MMS21YEL019C 804 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 PHO89YBR296C 1725 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 DLD2YDL178W 1593 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 GAP1YKR039W 1809 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 NAT4YMR069W 858 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 MSF1YPR047W 1410 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 UTR1YJR049C 1593 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-BLQ12266 ERG29YMR134W 714 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 TOM6YOR045W 186 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 YSR3YKR053C 1215 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 PEX12YMR026C 1200 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 SUT1YGL162W 900 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 LYS12YIL094C 1116 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 snR34snR34 203 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 SIR2YDL042C 1689 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 RRP1YDR087C 837 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 BUD16YEL029C 939 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 PCL6YER059W 1263 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 YER147C-AYER147C-A 411 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 YGR168CYGR168C 1131 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 YLR169WYLR169W 354 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 COQ2YNR041C 1119 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-BLQ12266 OAZ1YPL052W 879 nt8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60 ms