Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 FMS1YMR020W 1527 nt9.46□□□□□ -0.89
VHS3Q08438 SPP2YOR148C 558 nt9.46□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 RSC8YFR037C 1674 nt9.45□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 SDH5YOL071W 489 nt9.44□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 ARO8YGL202W 1503 nt9.44□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 YPS3YLR121C 1527 nt9.44□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 ACH1YBL015W 1581 nt9.44□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 GID7YCL039W 2238 nt9.43□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 SFP1YLR403W 2052 nt9.43□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 YDL086WYDL086W 822 nt9.43□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 YGR012WYGR012W 1182 nt9.43□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 MAE1YKL029C 2010 nt9.41□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.41□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 UGA4YDL210W 1716 nt9.41□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 SSN3YPL042C 1668 nt9.41□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 MSB4YOL112W 1479 nt9.4□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 KES1YPL145C 1305 nt9.4□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 FLR1YBR008C 1647 nt9.4□□□□□ -0.9
VHS3Q08438 DLD2YDL178W 1593 nt9.39□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 FCY21YER060W 1587 nt9.39□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 LSB6YJL100W 1824 nt9.38□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 SGA1YIL099W 1650 nt9.37□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 PHO23YNL097C 993 nt9.37□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 BET2YPR176C 978 nt9.37□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 UGP1YKL035W 1500 nt9.36□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 NPP1YCR026C 2229 nt9.36□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 RAD23YEL037C 1197 nt9.36□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 YER188WYER188W 720 nt9.35□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.35□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 MSC1YML128C 1542 nt9.35□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 DIG1YPL049C 1359 nt9.34□□□□□ -0.91
VHS3Q08438 YRF1-2YER190W 5046 nt9.33□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 BNI5YNL166C 1347 nt9.33□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 QDR2YIL121W 1629 nt9.32□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 FUB1YCR076C 753 nt9.3□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.3□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 HEM13YDR044W 987 nt9.29□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 OSH7YHR001W 1314 nt9.29□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 GND1YHR183W 1470 nt9.28□□□□□ -0.92
VHS3Q08438 YMR209CYMR209C 1374 nt9.27□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 NUC1YJL208C 990 nt9.27□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 CSM1YCR086W 573 nt9.26□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 RIB3YDR487C 627 nt9.26□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 ZAP1YJL056C 2643 nt9.25□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 YLR111WYLR111W 333 nt9.25□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 PRY1YJL079C 900 nt9.24□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 RAS2YNL098C 969 nt9.23□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 LSB5YCL034W 1065 nt9.23□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 ACO2YJL200C 2370 nt9.23□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 GLR1YPL091W 1452 nt9.22□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 SMM1YNR015W 1155 nt9.22□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 GID8YMR135C 1368 nt9.22□□□□□ -0.93
VHS3Q08438 ENT4YLL038C 744 nt9.2□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 YMR226CYMR226C 804 nt9.19□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 GPN2YOR262W 1044 nt9.18□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 RPT5YOR117W 1305 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 SOL2YCR073W-A 948 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 YGR139WYGR139W 339 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 AIM1YAL046C 357 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 CYT1YOR065W 930 nt9.17□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 DMA2YNL116W 1569 nt9.16□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 YKL133CYKL133C 1392 nt9.16□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 HMG2YLR450W 3138 nt9.16□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 TPO4YOR273C 1980 nt9.15□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 YLR046CYLR046C 813 nt9.15□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 ODC1YPL134C 933 nt9.15□□□□□ -0.94
VHS3Q08438 LOT5YKL183W 921 nt9.14□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 PSD1YNL169C 1503 nt9.14□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 MRS6YOR370C 1812 nt9.13□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 OYE2YHR179W 1203 nt9.13□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.13□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 EAF3YPR023C 1206 nt9.13□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 TAT2YOL020W 1779 nt9.13□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 SSL2YIL143C 2532 nt9.12□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 CAB5YDR196C 726 nt9.12□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 CWP2YKL096W-A 279 nt9.12□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 SAM3YPL274W 1764 nt9.12□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 YHR219WYHR219W 1875 nt9.11□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 MET8YBR213W 825 nt9.11□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.11□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 DLD3YEL071W 1491 nt9.1□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 YJL118WYJL118W 660 nt9.1□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 HXT12YIL170W 1374 nt9.09□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 MAS1YLR163C 1389 nt9.09□□□□□ -0.95
VHS3Q08438 RPD3YNL330C 1302 nt9.07□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 VRG4YGL225W 1014 nt9.07□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 MDM35YKL053C-A 261 nt9.07□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 RIB7YBR153W 735 nt9.07□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 ILV2YMR108W 2064 nt9.06□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 ESBP6YNL125C 2022 nt9.06□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 TPS1YBR126C 1488 nt9.05□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 MCM5YLR274W 2328 nt9.05□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 YDR455CYDR455C 309 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 LSM5YER146W 282 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 TIM44YIL022W 1296 nt9.04□□□□□ -0.96
VHS3Q08438 YMR244WYMR244W 1068 nt9.04□□□□□ -0.96
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