Protein–RNA interactions for Protein: Q07478

SUB2, ATP-dependent RNA helicase SUB2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUB2Q07478 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt10.75□□□□□ -0.69
SUB2Q07478 VRG4YGL225W 1014 nt10.72□□□□□ -0.69
SUB2Q07478 SAM35YHR083W 990 nt10.72□□□□□ -0.69
SUB2Q07478 KDX1YKL161C 1302 nt10.7□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 REC114YMR133W 1287 nt10.7□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 BNS1YGR230W 414 nt10.69□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 YGR259CYGR259C 441 nt10.69□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 PRY1YJL079C 900 nt10.69□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 HXT12YIL170W 1374 nt10.68□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 PAM17YKR065C 594 nt10.67□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 YHM2YMR241W 945 nt10.67□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 SED1YDR077W 1017 nt10.66□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 PAU5YFL020C 369 nt10.66□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 PUP1YOR157C 786 nt10.66□□□□□ -0.7
SUB2Q07478 ATG17YLR423C 1254 nt10.64□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YKR005CYKR005C 1578 nt10.64□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 RMA1YKL132C 1293 nt10.62□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 STP3YLR375W 1032 nt10.62□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 PGC1YPL206C 966 nt10.62□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.61□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.61□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.61□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.61□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.61□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 UGA4YDL210W 1716 nt10.61□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 ALD4YOR374W 1560 nt10.6□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YJL055WYJL055W 738 nt10.59□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 YBR232CYBR232C 360 nt10.59□□□□□ -0.71
SUB2Q07478 LIP1YMR298W 453 nt10.58□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 BOR1YNL275W 1731 nt10.57□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 CCT5YJR064W 1689 nt10.57□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 YJL064WYJL064W 396 nt10.54□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 TAF13YML098W 504 nt10.54□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 PRM5YIL117C 957 nt10.53□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 BMT6YLR063W 1098 nt10.53□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 ATG22YCL038C 1587 nt10.52□□□□□ -0.72
SUB2Q07478 LSB5YCL034W 1065 nt10.52□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 PRP4YPR178W 1398 nt10.51□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 IDP3YNL009W 1263 nt10.49□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 MEP3YPR138C 1470 nt10.49□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 CBK1YNL161W 2271 nt10.48□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 THI72YOR192C 1800 nt10.48□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 HSP60YLR259C 1719 nt10.47□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 TIM44YIL022W 1296 nt10.47□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 PAU19YMR325W 375 nt10.47□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 HMT1YBR034C 1047 nt10.47□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 YMR103CYMR103C 363 nt10.46□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 BRR1YPR057W 1026 nt10.46□□□□□ -0.73
SUB2Q07478 CSM1YCR086W 573 nt10.45□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 NUC1YJL208C 990 nt10.45□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 TOA2YKL058W 369 nt10.45□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 YPL251WYPL251W 303 nt10.45□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 HXT1YHR094C 1713 nt10.44□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 RIB7YBR153W 735 nt10.44□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 DBP1YPL119C 1854 nt10.44□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 DPS1YLL018C 1674 nt10.44□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 RPT5YOR117W 1305 nt10.42□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 MLS1YNL117W 1665 nt10.42□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 LEU9YOR108W 1815 nt10.42□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 HEM14YER014W 1620 nt10.41□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 YNL165WYNL165W 1221 nt10.41□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 YBL086CYBL086C 1401 nt10.41□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 IRC24YIR036C 792 nt10.4□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 YJL211CYJL211C 444 nt10.4□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 SLG1YOR008C 1137 nt10.4□□□□□ -0.74
SUB2Q07478 GAL3YDR009W 1563 nt10.39□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 PAR32YDL173W 888 nt10.37□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 HIF1YLL022C 1158 nt10.37□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 YMR262WYMR262W 942 nt10.37□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 TIP1YBR067C 633 nt10.34□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 EEB1YPL095C 1371 nt10.34□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 GND2YGR256W 1479 nt10.34□□□□□ -0.75
SUB2Q07478 POT1YIL160C 1254 nt10.33□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 BNI5YNL166C 1347 nt10.33□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 GNP1YDR508C 1992 nt10.32□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 SAM2YDR502C 1155 nt10.32□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 BUR6YER159C 429 nt10.32□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.32□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 GSF2YML048W 1212 nt10.32□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 RIB1YBL033C 1038 nt10.32□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 MCH5YOR306C 1566 nt10.31□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 YJR114WYJR114W 393 nt10.31□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 SWP1YMR149W 861 nt10.31□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 PHO23YNL097C 993 nt10.31□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 MHF1YOL086W-A 273 nt10.31□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 ESBP6YNL125C 2022 nt10.29□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 TUB4YLR212C 1422 nt10.28□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 SNZ1YMR096W 894 nt10.28□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 MSC1YML128C 1542 nt10.28□□□□□ -0.76
SUB2Q07478 SAM3YPL274W 1764 nt10.27□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 SEC61YLR378C 1443 nt10.27□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 RAS2YNL098C 969 nt10.27□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 SOD2YHR008C 702 nt10.25□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 IML3YBR107C 738 nt10.25□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 HDA1YNL021W 2121 nt10.25□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 TPS1YBR126C 1488 nt10.24□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 CTI6YPL181W 1521 nt10.24□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 OYE2YHR179W 1203 nt10.24□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 YIA6YIL006W 1122 nt10.24□□□□□ -0.77
SUB2Q07478 SHY1YGR112W 1170 nt10.23□□□□□ -0.77
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