Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 OPI10YOL032W 741 nt8.92□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 SPP2YOR148C 558 nt8.92□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 RSC8YFR037C 1674 nt8.91□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 YPS3YLR121C 1527 nt8.91□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 SEC61YLR378C 1443 nt8.91□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.91□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 CCT2YIL142W 1584 nt8.9□□□□□ -0.98
YHC1Q05900 DLD2YDL178W 1593 nt8.9□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 RIB3YDR487C 627 nt8.89□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 BNI5YNL166C 1347 nt8.88□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 YLR111WYLR111W 333 nt8.88□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 YMR244WYMR244W 1068 nt8.88□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 PHO23YNL097C 993 nt8.87□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 MSC1YML128C 1542 nt8.86□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 LSB6YJL100W 1824 nt8.85□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 CSM1YCR086W 573 nt8.85□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.85□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 SMM1YNR015W 1155 nt8.85□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 ARO8YGL202W 1503 nt8.85□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 HEM13YDR044W 987 nt8.84□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 PRY1YJL079C 900 nt8.84□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 COQ8YGL119W 1506 nt8.84□□□□□ -0.99
YHC1Q05900 RIM8YGL045W 1629 nt8.83□□□□□ -1
YHC1Q05900 VPS62YGR141W 1404 nt8.83□□□□□ -1
YHC1Q05900 GND1YHR183W 1470 nt8.83□□□□□ -1
YHC1Q05900 FUB1YCR076C 753 nt8.82□□□□□ -1
YHC1Q05900 YER188WYER188W 720 nt8.82□□□□□ -1
YHC1Q05900 YMR226CYMR226C 804 nt8.82□□□□□ -1
YHC1Q05900 YGL114WYGL114W 2178 nt8.82□□□□□ -1
YHC1Q05900 YDL086WYDL086W 822 nt8.79□□□□□ -1
YHC1Q05900 LOT5YKL183W 921 nt8.79□□□□□ -1
YHC1Q05900 KES1YPL145C 1305 nt8.78□□□□□ -1
YHC1Q05900 BET2YPR176C 978 nt8.77□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 SAM3YPL274W 1764 nt8.76□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 UGP1YKL035W 1500 nt8.76□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 SGA1YIL099W 1650 nt8.76□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 NUC1YJL208C 990 nt8.75□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 ZAP1YJL056C 2643 nt8.75□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 OSH7YHR001W 1314 nt8.75□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 RPM1RPM1 483 nt8.74□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 HIS2YFR025C 1008 nt8.73□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 RAS2YNL098C 969 nt8.73□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 LSB5YCL034W 1065 nt8.73□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 TAT2YOL020W 1779 nt8.73□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 QDR2YIL121W 1629 nt8.72□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 RBG2YGR173W 1107 nt8.72□□□□□ -1.01
YHC1Q05900 HXT12YIL170W 1374 nt8.71□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 SFP1YLR403W 2052 nt8.71□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 RPT5YOR117W 1305 nt8.7□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.7□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 DIG1YPL049C 1359 nt8.7□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 YJL055WYJL055W 738 nt8.69□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 YJL118WYJL118W 660 nt8.69□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 MET2YNL277W 1461 nt8.69□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 SOL2YCR073W-A 948 nt8.68□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 EAF3YPR023C 1206 nt8.68□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 VRG4YGL225W 1014 nt8.67□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 OYE2YHR179W 1203 nt8.66□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 GID8YMR135C 1368 nt8.65□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 AIM1YAL046C 357 nt8.65□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 GPN2YOR262W 1044 nt8.65□□□□□ -1.02
YHC1Q05900 TPS1YBR126C 1488 nt8.64□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 YDR455CYDR455C 309 nt8.64□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 YPI1YFR003C 468 nt8.64□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 MAE1YKL029C 2010 nt8.64□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 RIB2YOL066C 1776 nt8.63□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 GAL3YDR009W 1563 nt8.62□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 MRS6YOR370C 1812 nt8.62□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.62□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.62□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.62□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.62□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 YMR209CYMR209C 1374 nt8.61□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 YNR029CYNR029C 1290 nt8.61□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 YHR219WYHR219W 1875 nt8.61□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 YKL133CYKL133C 1392 nt8.6□□□□□ -1.03
YHC1Q05900 NPP1YCR026C 2229 nt8.58□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 LSM5YER146W 282 nt8.58□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 ENT4YLL038C 744 nt8.58□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 RIB7YBR153W 735 nt8.58□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 DDI1YER143W 1287 nt8.57□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 YLR046CYLR046C 813 nt8.57□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 TMA23YMR269W 636 nt8.57□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 DLD3YEL071W 1491 nt8.57□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 SSL2YIL143C 2532 nt8.56□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 ADH1YOL086C 1047 nt8.56□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 ODC1YPL134C 933 nt8.55□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 ERG13YML126C 1476 nt8.55□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 ITR2YOL103W 1830 nt8.52□□□□□ -1.04
YHC1Q05900 SAC7YDR389W 1965 nt8.52□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 HMG2YLR450W 3138 nt8.51□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 LSR1LSR1 1175 nt8.51□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 IMO32YGR031W 1029 nt8.5□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 RRT8YOL048C 1029 nt8.5□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 TPO4YOR273C 1980 nt8.5□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 CWP2YKL096W-A 279 nt8.48□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 DMA2YNL116W 1569 nt8.48□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 DAK2YFL053W 1776 nt8.47□□□□□ -1.05
YHC1Q05900 SNZ1YMR096W 894 nt8.46□□□□□ -1.06
YHC1Q05900 RPD3YNL330C 1302 nt8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.9 ms