Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 ARO8YGL202W 1503 nt10.66□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 BET2YPR176C 978 nt10.65□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 SSN3YPL042C 1668 nt10.65□□□□□ -0.7
HRQ1Q05549 DLD2YDL178W 1593 nt10.65□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 COQ8YGL119W 1506 nt10.64□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 LSB6YJL100W 1824 nt10.64□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 BNI5YNL166C 1347 nt10.62□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 YGL114WYGL114W 2178 nt10.62□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 FCY21YER060W 1587 nt10.61□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 SEC61YLR378C 1443 nt10.61□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 HEM13YDR044W 987 nt10.59□□□□□ -0.71
HRQ1Q05549 HEL2YDR266C 1920 nt10.58□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 UGP1YKL035W 1500 nt10.58□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 KES1YPL145C 1305 nt10.58□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 FUB1YCR076C 753 nt10.56□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 OXA1YER154W 1209 nt10.56□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.56□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 VPS62YGR141W 1404 nt10.56□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 GLR1YPL091W 1452 nt10.55□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 MSC1YML128C 1542 nt10.54□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 SGA1YIL099W 1650 nt10.54□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 CSM1YCR086W 573 nt10.54□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 RAD23YEL037C 1197 nt10.54□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 YGR139WYGR139W 339 nt10.54□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 PRY1YJL079C 900 nt10.53□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 PHO23YNL097C 993 nt10.53□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 SMM1YNR015W 1155 nt10.53□□□□□ -0.72
HRQ1Q05549 YER188WYER188W 720 nt10.52□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 APT2YDR441C 546 nt10.51□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 QDR2YIL121W 1629 nt10.51□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 YDL086WYDL086W 822 nt10.5□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 HIS2YFR025C 1008 nt10.5□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 YLR111WYLR111W 333 nt10.5□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 YMR209CYMR209C 1374 nt10.49□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 TAT2YOL020W 1779 nt10.49□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 RIB3YDR487C 627 nt10.48□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 ZAP1YJL056C 2643 nt10.47□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 OSH7YHR001W 1314 nt10.46□□□□□ -0.73
HRQ1Q05549 SAM3YPL274W 1764 nt10.45□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 GND1YHR183W 1470 nt10.45□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.45□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 RAS2YNL098C 969 nt10.45□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 GID8YMR135C 1368 nt10.44□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 YMR244WYMR244W 1068 nt10.44□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 NUC1YJL208C 990 nt10.43□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 LOT5YKL183W 921 nt10.43□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 DIG1YPL049C 1359 nt10.42□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 SOL2YCR073W-A 948 nt10.41□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 YJL055WYJL055W 738 nt10.41□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 MRS6YOR370C 1812 nt10.41□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 AIM1YAL046C 357 nt10.4□□□□□ -0.74
HRQ1Q05549 YDR455CYDR455C 309 nt10.39□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 LSB5YCL034W 1065 nt10.37□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 YKL133CYKL133C 1392 nt10.36□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 YJL118WYJL118W 660 nt10.35□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 EAF3YPR023C 1206 nt10.35□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 RPT5YOR117W 1305 nt10.34□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 YHR219WYHR219W 1875 nt10.34□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 TPS1YBR126C 1488 nt10.34□□□□□ -0.75
HRQ1Q05549 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.32□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 VRG4YGL225W 1014 nt10.32□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 OYE2YHR179W 1203 nt10.32□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 YMR226CYMR226C 804 nt10.32□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 LSM5YER146W 282 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 GPN2YOR262W 1044 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 ODC1YPL134C 933 nt10.31□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 MAE1YKL029C 2010 nt10.3□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 DDI1YER143W 1287 nt10.29□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 LSR1LSR1 1175 nt10.29□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 RIB2YOL066C 1776 nt10.29□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 YLR046CYLR046C 813 nt10.28□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 HXT12YIL170W 1374 nt10.27□□□□□ -0.76
HRQ1Q05549 SSL2YIL143C 2532 nt10.27□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 DLD3YEL071W 1491 nt10.26□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 ITR2YOL103W 1830 nt10.26□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 GAL3YDR009W 1563 nt10.24□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 RBG2YGR173W 1107 nt10.24□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 ERG13YML126C 1476 nt10.23□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 DMA2YNL116W 1569 nt10.22□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 TMA23YMR269W 636 nt10.21□□□□□ -0.77
HRQ1Q05549 ENT4YLL038C 744 nt10.2□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 PSD1YNL169C 1503 nt10.2□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 ACO2YJL200C 2370 nt10.19□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 SAC7YDR389W 1965 nt10.19□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 YNR029CYNR029C 1290 nt10.18□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 YPI1YFR003C 468 nt10.17□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 RIB7YBR153W 735 nt10.15□□□□□ -0.78
HRQ1Q05549 RPD3YNL330C 1302 nt10.14□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 IMO32YGR031W 1029 nt10.12□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 TIM44YIL022W 1296 nt10.12□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 ADH1YOL086C 1047 nt10.12□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 TIP1YBR067C 633 nt10.12□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 MDM35YKL053C-A 261 nt10.11□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 YHR218WYHR218W 1812 nt10.1□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 CWP2YKL096W-A 279 nt10.1□□□□□ -0.79
HRQ1Q05549 HXT10YFL011W 1641 nt10.09□□□□□ -0.79
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