Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNA1BQ00975 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1BQ00975 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA1BQ00975 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA1BQ00975 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA1BQ00975 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1BQ00975 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNA1BQ00975 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNA1BQ00975 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1151.8 ms