Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TGFB2P61812 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TGFB2P61812 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TGFB2P61812 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TGFB2P61812 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TGFB2P61812 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TGFB2P61812 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TGFB2P61812 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TGFB2P61812 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TGFB2P61812 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TGFB2P61812 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TGFB2P61812 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TGFB2P61812 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TGFB2P61812 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TGFB2P61812 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TGFB2P61812 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TGFB2P61812 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TGFB2P61812 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TGFB2P61812 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TGFB2P61812 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TGFB2P61812 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TGFB2P61812 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TGFB2P61812 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
TGFB2P61812 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TGFB2P61812 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TGFB2P61812 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms