Protein–RNA interactions for Protein: P53437

RRN9, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9, yeastyeast

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN9P53437 PET8YNL003C 855 nt8.53□□□□□ -1.04
RRN9P53437 BRR1YPR057W 1026 nt8.53□□□□□ -1.04
RRN9P53437 SBA1YKL117W 651 nt8.52□□□□□ -1.05
RRN9P53437 OYE3YPL171C 1203 nt8.52□□□□□ -1.05
RRN9P53437 KES1YPL145C 1305 nt8.52□□□□□ -1.05
RRN9P53437 HEM14YER014W 1620 nt8.51□□□□□ -1.05
RRN9P53437 TOA2YKL058W 369 nt8.51□□□□□ -1.05
RRN9P53437 SGA1YIL099W 1650 nt8.5□□□□□ -1.05
RRN9P53437 TPO4YOR273C 1980 nt8.5□□□□□ -1.05
RRN9P53437 YGR012WYGR012W 1182 nt8.49□□□□□ -1.05
RRN9P53437 BET2YPR176C 978 nt8.49□□□□□ -1.05
RRN9P53437 LSB6YJL100W 1824 nt8.48□□□□□ -1.05
RRN9P53437 MSB4YOL112W 1479 nt8.48□□□□□ -1.05
RRN9P53437 GTB1YDR221W 2109 nt8.48□□□□□ -1.05
RRN9P53437 UGA4YDL210W 1716 nt8.47□□□□□ -1.05
RRN9P53437 GAL2YLR081W 1725 nt8.46□□□□□ -1.05
RRN9P53437 GND2YGR256W 1479 nt8.46□□□□□ -1.05
RRN9P53437 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.46□□□□□ -1.06
RRN9P53437 SDH5YOL071W 489 nt8.46□□□□□ -1.06
RRN9P53437 YMR103CYMR103C 363 nt8.45□□□□□ -1.06
RRN9P53437 SPP2YOR148C 558 nt8.44□□□□□ -1.06
RRN9P53437 MEP3YPR138C 1470 nt8.44□□□□□ -1.06
RRN9P53437 ACH1YBL015W 1581 nt8.44□□□□□ -1.06
RRN9P53437 FMS1YMR020W 1527 nt8.43□□□□□ -1.06
RRN9P53437 RAD23YEL037C 1197 nt8.42□□□□□ -1.06
RRN9P53437 GLR1YPL091W 1452 nt8.42□□□□□ -1.06
RRN9P53437 ZAP1YJL056C 2643 nt8.42□□□□□ -1.06
RRN9P53437 VPS62YGR141W 1404 nt8.41□□□□□ -1.06
RRN9P53437 RSC8YFR037C 1674 nt8.4□□□□□ -1.06
RRN9P53437 FCY21YER060W 1587 nt8.4□□□□□ -1.06
RRN9P53437 PSD1YNL169C 1503 nt8.39□□□□□ -1.07
RRN9P53437 CAB5YDR196C 726 nt8.39□□□□□ -1.07
RRN9P53437 APT2YDR441C 546 nt8.39□□□□□ -1.07
RRN9P53437 URA8YJR103W 1737 nt8.39□□□□□ -1.07
RRN9P53437 QDR2YIL121W 1629 nt8.39□□□□□ -1.07
RRN9P53437 YDL086WYDL086W 822 nt8.38□□□□□ -1.07
RRN9P53437 SAM2YDR502C 1155 nt8.38□□□□□ -1.07
RRN9P53437 CYT1YOR065W 930 nt8.37□□□□□ -1.07
RRN9P53437 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.37□□□□□ -1.07
RRN9P53437 YPS3YLR121C 1527 nt8.37□□□□□ -1.07
RRN9P53437 TOK1YJL093C 2076 nt8.37□□□□□ -1.07
RRN9P53437 DMA2YNL116W 1569 nt8.36□□□□□ -1.07
RRN9P53437 OXA1YER154W 1209 nt8.36□□□□□ -1.07
RRN9P53437 SEC61YLR378C 1443 nt8.36□□□□□ -1.07
RRN9P53437 FLR1YBR008C 1647 nt8.36□□□□□ -1.07
RRN9P53437 YHL008CYHL008C 1884 nt8.35□□□□□ -1.07
RRN9P53437 RIB3YDR487C 627 nt8.35□□□□□ -1.07
RRN9P53437 YMR244WYMR244W 1068 nt8.35□□□□□ -1.07
RRN9P53437 DIG1YPL049C 1359 nt8.35□□□□□ -1.07
RRN9P53437 YLR111WYLR111W 333 nt8.34□□□□□ -1.07
RRN9P53437 DLD2YDL178W 1593 nt8.32□□□□□ -1.08
RRN9P53437 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt8.32□□□□□ -1.08
RRN9P53437 GID8YMR135C 1368 nt8.32□□□□□ -1.08
RRN9P53437 PHO23YNL097C 993 nt8.31□□□□□ -1.08
RRN9P53437 ODC1YPL134C 933 nt8.31□□□□□ -1.08
RRN9P53437 BNI5YNL166C 1347 nt8.3□□□□□ -1.08
RRN9P53437 MSC1YML128C 1542 nt8.3□□□□□ -1.08
RRN9P53437 YMR226CYMR226C 804 nt8.3□□□□□ -1.08
RRN9P53437 CSM1YCR086W 573 nt8.29□□□□□ -1.08
RRN9P53437 SMM1YNR015W 1155 nt8.29□□□□□ -1.08
RRN9P53437 RSC4YKR008W 1878 nt8.29□□□□□ -1.08
RRN9P53437 GND1YHR183W 1470 nt8.28□□□□□ -1.08
RRN9P53437 PRY1YJL079C 900 nt8.28□□□□□ -1.08
RRN9P53437 SSL2YIL143C 2532 nt8.27□□□□□ -1.09
RRN9P53437 FUB1YCR076C 753 nt8.27□□□□□ -1.09
RRN9P53437 HEM13YDR044W 987 nt8.27□□□□□ -1.09
RRN9P53437 MRS6YOR370C 1812 nt8.26□□□□□ -1.09
RRN9P53437 YKL133CYKL133C 1392 nt8.26□□□□□ -1.09
RRN9P53437 YHR218WYHR218W 1812 nt8.25□□□□□ -1.09
RRN9P53437 YER188WYER188W 720 nt8.25□□□□□ -1.09
RRN9P53437 YRF1-2YER190W 5046 nt8.23□□□□□ -1.09
RRN9P53437 LOT5YKL183W 921 nt8.23□□□□□ -1.09
RRN9P53437 THI72YOR192C 1800 nt8.22□□□□□ -1.09
RRN9P53437 MDM35YKL053C-A 261 nt8.21□□□□□ -1.1
RRN9P53437 YHR219WYHR219W 1875 nt8.21□□□□□ -1.1
RRN9P53437 SAM3YPL274W 1764 nt8.2□□□□□ -1.1
RRN9P53437 RBG2YGR173W 1107 nt8.2□□□□□ -1.1
RRN9P53437 NUC1YJL208C 990 nt8.19□□□□□ -1.1
RRN9P53437 CWP2YKL096W-A 279 nt8.19□□□□□ -1.1
RRN9P53437 LSB5YCL034W 1065 nt8.18□□□□□ -1.1
RRN9P53437 OSH7YHR001W 1314 nt8.18□□□□□ -1.1
RRN9P53437 RAS2YNL098C 969 nt8.17□□□□□ -1.1
RRN9P53437 HXT12YIL170W 1374 nt8.17□□□□□ -1.1
RRN9P53437 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.16□□□□□ -1.1
RRN9P53437 HXK1YFR053C 1458 nt8.16□□□□□ -1.1
RRN9P53437 AIM1YAL046C 357 nt8.16□□□□□ -1.1
RRN9P53437 MCM5YLR274W 2328 nt8.16□□□□□ -1.1
RRN9P53437 TAT2YOL020W 1779 nt8.16□□□□□ -1.1
RRN9P53437 RPT5YOR117W 1305 nt8.15□□□□□ -1.1
RRN9P53437 FRA1YLL029W 2250 nt8.15□□□□□ -1.1
RRN9P53437 HXT10YFL011W 1641 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 DLD3YEL071W 1491 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 YJL055WYJL055W 738 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 YJL118WYJL118W 660 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 ENT4YLL038C 744 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 YLR046CYLR046C 813 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 ALD5YER073W 1563 nt8.14□□□□□ -1.11
RRN9P53437 RPD3YNL330C 1302 nt8.13□□□□□ -1.11
RRN9P53437 SOL2YCR073W-A 948 nt8.13□□□□□ -1.11
RRN9P53437 VRG4YGL225W 1014 nt8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65 ms