Protein–RNA interactions for Protein: P48567

PUS4, tRNA pseudouridine synthase 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS4P48567 DMA2YNL116W 1569 nt8.01□□□□□ -1.13
PUS4P48567 HIP1YGR191W 1812 nt8.01□□□□□ -1.13
PUS4P48567 OPI10YOL032W 741 nt8.01□□□□□ -1.13
PUS4P48567 YOR325WYOR325W 474 nt8.01□□□□□ -1.13
PUS4P48567 SHH4YLR164W 507 nt8□□□□□ -1.13
PUS4P48567 FAF1YIL019W 1041 nt7.99□□□□□ -1.13
PUS4P48567 UTR1YJR049C 1593 nt7.99□□□□□ -1.13
PUS4P48567 TOM6YOR045W 186 nt7.99□□□□□ -1.13
PUS4P48567 TIF6YPR016C 738 nt7.99□□□□□ -1.13
PUS4P48567 KES1YPL145C 1305 nt7.99□□□□□ -1.13
PUS4P48567 RPS14BYJL191W 417 nt7.98□□□□□ -1.13
PUS4P48567 RBG1YAL036C 1110 nt7.98□□□□□ -1.13
PUS4P48567 YAR028WYAR028W 705 nt7.98□□□□□ -1.13
PUS4P48567 TSC10YBR265W 963 nt7.98□□□□□ -1.13
PUS4P48567 RBG2YGR173W 1107 nt7.97□□□□□ -1.13
PUS4P48567 ARO8YGL202W 1503 nt7.97□□□□□ -1.13
PUS4P48567 PCP1YGR101W 1041 nt7.96□□□□□ -1.14
PUS4P48567 YMR226CYMR226C 804 nt7.96□□□□□ -1.14
PUS4P48567 YOR072WYOR072W 315 nt7.96□□□□□ -1.14
PUS4P48567 YHR131CYHR131C 2553 nt7.96□□□□□ -1.14
PUS4P48567 SGA1YIL099W 1650 nt7.95□□□□□ -1.14
PUS4P48567 DIF1YLR437C 402 nt7.95□□□□□ -1.14
PUS4P48567 PEX2YJL210W 816 nt7.94□□□□□ -1.14
PUS4P48567 YTH1YPR107C 627 nt7.94□□□□□ -1.14
PUS4P48567 CCT2YIL142W 1584 nt7.93□□□□□ -1.14
PUS4P48567 MGM101YJR144W 810 nt7.93□□□□□ -1.14
PUS4P48567 CWC15YDR163W 528 nt7.92□□□□□ -1.14
PUS4P48567 BET2YPR176C 978 nt7.92□□□□□ -1.14
PUS4P48567 AAC3YBR085W 924 nt7.92□□□□□ -1.14
PUS4P48567 ALP1YNL270C 1722 nt7.92□□□□□ -1.14
PUS4P48567 RAD23YEL037C 1197 nt7.91□□□□□ -1.14
PUS4P48567 MEP3YPR138C 1470 nt7.91□□□□□ -1.14
PUS4P48567 RSC8YFR037C 1674 nt7.91□□□□□ -1.14
PUS4P48567 HXT1YHR094C 1713 nt7.9□□□□□ -1.14
PUS4P48567 YLR111WYLR111W 333 nt7.9□□□□□ -1.14
PUS4P48567 SDH5YOL071W 489 nt7.9□□□□□ -1.14
PUS4P48567 FTH1YBR207W 1398 nt7.88□□□□□ -1.15
PUS4P48567 SED1YDR077W 1017 nt7.88□□□□□ -1.15
PUS4P48567 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt7.88□□□□□ -1.15
PUS4P48567 YHR218WYHR218W 1812 nt7.86□□□□□ -1.15
PUS4P48567 SHY1YGR112W 1170 nt7.84□□□□□ -1.15
PUS4P48567 NSG2YNL156C 900 nt7.84□□□□□ -1.15
PUS4P48567 ATG22YCL038C 1587 nt7.84□□□□□ -1.15
PUS4P48567 APT2YDR441C 546 nt7.83□□□□□ -1.16
PUS4P48567 TOM71YHR117W 1920 nt7.83□□□□□ -1.16
PUS4P48567 DBP1YPL119C 1854 nt7.83□□□□□ -1.16
PUS4P48567 YGR012WYGR012W 1182 nt7.82□□□□□ -1.16
PUS4P48567 HDA1YNL021W 2121 nt7.82□□□□□ -1.16
PUS4P48567 AKR2YOR034C 2250 nt7.81□□□□□ -1.16
PUS4P48567 LIP1YMR298W 453 nt7.81□□□□□ -1.16
PUS4P48567 ODC1YPL134C 933 nt7.8□□□□□ -1.16
PUS4P48567 MTG2YHR168W 1557 nt7.8□□□□□ -1.16
PUS4P48567 URH1YDR400W 1023 nt7.79□□□□□ -1.16
PUS4P48567 SAM1YLR180W 1149 nt7.79□□□□□ -1.16
PUS4P48567 YLR173WYLR173W 1827 nt7.79□□□□□ -1.16
PUS4P48567 PUS5YLR165C 765 nt7.78□□□□□ -1.16
PUS4P48567 YLR279WYLR279W 390 nt7.78□□□□□ -1.16
PUS4P48567 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.78□□□□□ -1.16
PUS4P48567 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.78□□□□□ -1.16
PUS4P48567 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.78□□□□□ -1.16
PUS4P48567 MEX67YPL169C 1800 nt7.78□□□□□ -1.16
PUS4P48567 ZAP1YJL056C 2643 nt7.77□□□□□ -1.17
PUS4P48567 RIB3YDR487C 627 nt7.77□□□□□ -1.17
PUS4P48567 URA6YKL024C 615 nt7.77□□□□□ -1.17
PUS4P48567 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.77□□□□□ -1.17
PUS4P48567 LSB6YJL100W 1824 nt7.76□□□□□ -1.17
PUS4P48567 TPN1YGL186C 1740 nt7.76□□□□□ -1.17
PUS4P48567 QDR2YIL121W 1629 nt7.76□□□□□ -1.17
PUS4P48567 MTO1YGL236C 2010 nt7.76□□□□□ -1.17
PUS4P48567 RMA1YKL132C 1293 nt7.75□□□□□ -1.17
PUS4P48567 SFL1YOR140W 2301 nt7.75□□□□□ -1.17
PUS4P48567 YJL118WYJL118W 660 nt7.74□□□□□ -1.17
PUS4P48567 IDP3YNL009W 1263 nt7.74□□□□□ -1.17
PUS4P48567 ECM27YJR106W 2178 nt7.73□□□□□ -1.17
PUS4P48567 HXT10YFL011W 1641 nt7.73□□□□□ -1.17
PUS4P48567 GND1YHR183W 1470 nt7.73□□□□□ -1.17
PUS4P48567 DIG1YPL049C 1359 nt7.72□□□□□ -1.17
PUS4P48567 YIL177CYIL177C 5277 nt7.72□□□□□ -1.17
PUS4P48567 FHN1YGR131W 525 nt7.72□□□□□ -1.17
PUS4P48567 MDM35YKL053C-A 261 nt7.72□□□□□ -1.17
PUS4P48567 LSR1LSR1 1175 nt7.71□□□□□ -1.18
PUS4P48567 LEU9YOR108W 1815 nt7.71□□□□□ -1.18
PUS4P48567 NBA1YOL070C 1506 nt7.7□□□□□ -1.18
PUS4P48567 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.7□□□□□ -1.18
PUS4P48567 PAU21YOR394W 495 nt7.7□□□□□ -1.18
PUS4P48567 PAU22YPL282C 495 nt7.7□□□□□ -1.18
PUS4P48567 RTG2YGL252C 1767 nt7.69□□□□□ -1.18
PUS4P48567 LCP5YER127W 1074 nt7.69□□□□□ -1.18
PUS4P48567 ALR1YOL130W 2580 nt7.69□□□□□ -1.18
PUS4P48567 MDL2YPL270W 2322 nt7.69□□□□□ -1.18
PUS4P48567 YBL086CYBL086C 1401 nt7.69□□□□□ -1.18
PUS4P48567 MSB4YOL112W 1479 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS4P48567 FCY21YER060W 1587 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS4P48567 PET8YNL003C 855 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS4P48567 ZTA1YBR046C 1005 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS4P48567 VPS62YGR141W 1404 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS4P48567 SSL2YIL143C 2532 nt7.68□□□□□ -1.18
PUS4P48567 YDL086WYDL086W 822 nt7.67□□□□□ -1.18
PUS4P48567 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt7.67□□□□□ -1.18
PUS4P48567 PHO23YNL097C 993 nt7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.6 ms