Protein–RNA interactions for Protein: P02774

GC, Vitamin D-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCP02774 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GCP02774 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GCP02774 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
GCP02774 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
GCP02774 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GCP02774 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
GCP02774 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
GCP02774 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
GCP02774 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
GCP02774 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
GCP02774 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
GCP02774 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GCP02774 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
GCP02774 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
GCP02774 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GCP02774 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
GCP02774 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
GCP02774 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GCP02774 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GCP02774 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
GCP02774 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
GCP02774 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GCP02774 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GCP02774 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GCP02774 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GCP02774 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GCP02774 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
GCP02774 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
GCP02774 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GCP02774 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GCP02774 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
GCP02774 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
GCP02774 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
GCP02774 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GCP02774 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
GCP02774 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
GCP02774 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
GCP02774 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
GCP02774 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
GCP02774 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GCP02774 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GCP02774 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
GCP02774 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
GCP02774 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
GCP02774 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GCP02774 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GCP02774 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
GCP02774 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
GCP02774 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
GCP02774 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
GCP02774 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
GCP02774 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GCP02774 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
GCP02774 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
GCP02774 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
GCP02774 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
GCP02774 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GCP02774 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
GCP02774 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GCP02774 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GCP02774 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
GCP02774 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GCP02774 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
GCP02774 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GCP02774 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GCP02774 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GCP02774 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GCP02774 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GCP02774 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GCP02774 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GCP02774 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GCP02774 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GCP02774 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GCP02774 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GCP02774 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GCP02774 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GCP02774 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GCP02774 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GCP02774 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GCP02774 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GCP02774 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GCP02774 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GCP02774 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GCP02774 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GCP02774 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
GCP02774 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GCP02774 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GCP02774 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GCP02774 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
GCP02774 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
GCP02774 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GCP02774 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GCP02774 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
GCP02774 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms