Protein–RNA interactions for Protein: O75973

C1QL1, C1q-related factor, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL1O75973 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QL1O75973 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QL1O75973 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QL1O75973 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1QL1O75973 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1QL1O75973 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1QL1O75973 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1QL1O75973 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1QL1O75973 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1QL1O75973 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1QL1O75973 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C1QL1O75973 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C1QL1O75973 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms