Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP8O43159 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP8O43159 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP8O43159 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP8O43159 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP8O43159 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP8O43159 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRP8O43159 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRP8O43159 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRP8O43159 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP8O43159 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRP8O43159 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRP8O43159 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRP8O43159 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP8O43159 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRP8O43159 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP8O43159 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP8O43159 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRP8O43159 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP8O43159 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP8O43159 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRP8O43159 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP8O43159 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRP8O43159 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP8O43159 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRP8O43159 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP8O43159 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP8O43159 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRP8O43159 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP8O43159 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRP8O43159 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP8O43159 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP8O43159 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRP8O43159 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP8O43159 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP8O43159 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRP8O43159 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRP8O43159 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRP8O43159 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP8O43159 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP8O43159 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRP8O43159 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP8O43159 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRP8O43159 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRP8O43159 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRP8O43159 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP8O43159 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP8O43159 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP8O43159 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRP8O43159 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRP8O43159 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP8O43159 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP8O43159 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RRP8O43159 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP8O43159 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRP8O43159 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP8O43159 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP8O43159 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRP8O43159 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRP8O43159 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRP8O43159 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP8O43159 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP8O43159 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP8O43159 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP8O43159 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP8O43159 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP8O43159 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP8O43159 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP8O43159 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP8O43159 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP8O43159 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP8O43159 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP8O43159 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP8O43159 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP8O43159 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP8O43159 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP8O43159 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP8O43159 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRP8O43159 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms