Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.34■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PIK3C2BO00750 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PIK3C2BO00750 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
PIK3C2BO00750 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
PIK3C2BO00750 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PIK3C2BO00750 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
PIK3C2BO00750 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PIK3C2BO00750 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PIK3C2BO00750 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PIK3C2BO00750 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PIK3C2BO00750 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PIK3C2BO00750 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
PIK3C2BO00750 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
PIK3C2BO00750 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
PIK3C2BO00750 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PIK3C2BO00750 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms